凍干機是真空冷凍干燥機的簡稱，是利用升華原理對各種物料樣品進行穩定化干燥的設備。廣泛應用于生物醫藥凍干、中藥材凍干、食品凍干、酶制品凍干、菌種凍干等研發和加工使用。隨著FD技術發展，凍干機在肉蓯蓉凍干加工得到應用，在行業內俗稱為肉蓯蓉凍干機，具有保存肉蓯蓉原有生物堿、氨基酸、胱氨酸、維生素和礦物質等營養成分不變，能在常溫下保存較長時間的特點優勢。

肉蓯蓉凍干加工需要提前將物料進行挑選、清洗、切片、滅菌、瀝干等工藝流程后，將含水的肉蓯蓉在TF凍干機進行低溫冷凍結晶成固態，再通過真空系統和循環系統進行一次干燥和解析干燥運行處理，使肉蓯蓉中固體冰在真空環境下，不經液態直接升華成氣體除去，留下海綿多孔狀含水在2~5%的凍干肉蓯蓉物料，肉蓯蓉整個凍干過程通過電控PLC系統控制溫度、真空等運行及確定凍干結束。整個凍干處理過程是在低溫和高真空環境下運行，肉蓯蓉的營養成分和微生物活性物質得到保護，酶的生長和氧化作用幾乎無法進行，肉蓯蓉物質中的揮發性成分和受熱變性的營養成分和芳香成分損失非常少，所以能能極大限度地保持物質性狀，營養成分和色、香、味、形等基本不變。

凍干機在肉蓯蓉凍干加工應用能保存原有營養成分和顏色、體形等基本不變，復水性好，含水極少能在常溫下保存1~3年。解決肉蓯蓉藥性成分和營養成分保留，方便存儲、流通和使用等問題。目前廣泛應用于冬蟲夏草凍干、野生菌凍干、食用菌凍干、靈芝凍干、三七凍干、人參凍干等加工生產。